Ödeme şeklinde mal mukabili belirtilen tüm ürünler için, program KKDF vergisini mal bedeli üzerinden doların alış kuruyla çarpıp %6 oranını alarak hesaplama yapmaktadır.
Fakat KKDF hesaplaması ve hesaplanmaması gereken durumlar bulunmaktadır.
1- KKDF hesaplaması yapılmıyor ise, beyanname antrepo beyannamesi olabilir. Antrepo beyannamesi; Malın gerçek bir ithalat değil, sadece antrepoya alınma işlemi olduğu için antrepo beyannamesinde damga vergisi hariç tüm vergiler teminata bağlanmaktadır. KKDF de peşin ödenen bir vergi olduğu için, antrepo beyannamesinde hesaplanmamaktadır.
2- Hesaplama yapmaması kullanılan muafiyet ve ilgili GTİP'in KKDF kesintisi yapılmayan tebliği (Karar Sayısı : 2015/7511) içinde olmasından da kaynaklanabilmektedir.
3- KKDF'nin hesaplanabilmesi için, kalemlerin tutarının en az 0,02 olması gerekmektedir. Bu tutardan daha küçük tutar girişi olduğunda, örn; 0,01 sistem bunu değer olarak algılamadığından hesaplama yapmamaktadır.